Центр создан с целью решить одну из актуальнейших проблем современного здравоохранения — лечение и реабилитация сложнейшей категории пациентов с тяжёлыми повреждениями головного мозга, длительно пребывающих на искусственной вентиляции лёгких и имеющих нарушения сознания.
ФНКЦ РР представляет собой принципиально новую структуру учреждения, объединяя в себе научную, медицинскую и образовательную составляющие: для полноценного решения указанной проблемы проводит фундаментальные и прикладные научные исследования, осуществляет интенсивное восстановительное лечение и реабилитацию пациентов, готовит высококвалифицированные медицинские кадры в аспирантуре и ординатуре, ведёт научно-экспертную деятельность, имеет собственный диссертационный совет и выпускает реферируемый научный журнал.